Topix hamnade på 1 076,57 en förlust på 4,6 procent. Topix föll tidigare under tisdagens handel med hela fem procent.
Japans centralbank öste på tisdagen in motsvarande två biljoner yen (drygt 128 miljarder kronor) från sina krisfonder i Tokyos penningmarknad för att försöka dämpa det tumult som uppstått efter det amerikanska representanthusets beslut.
Det är den tionde dagen i rad som Bank of Japan pumpar in pengar i hemlandets ekonomiska system.
Hongkongbörsen tappade 5,6 procent när tisdagsmorgonens handel öppnade. Men när förmiddagshandeln avslutades hade Hongkongbörsen återhämtat sig och hamnade på minus 2,4.
Hang Seng Index slutade på 17 447,66 punkter, ner 433,02.
% är glada
% är likgiltiga