Planet, som kom från Mallorca, fick cirkulera runt innan Luftfartsverket kunde ringa in personal till tornet och ta ner planet 28 minuter försenat.
Felet verkar ha berott på en kommunikationsmiss mellan Luftfartsverket och flygplatsen, uppger Sveriges Radio Jönköping.
– Vi har ingen verksamhet vid flygplatsen vid det här tillfället. Det låg ingen beställning på att tornet skulle vara bemannat, säger Carl Selling på Luftfartsverket till TT.