Mannen greps under dramatiska omständigheter i Venezuela förra året. Sverige klagade på att han greps och sedan snabbt utlämnades till Colombia utan att svenska myndigheter informerades, men har ännu inte fått något svar.
UD:s presschef Anders Jörle vill inte kommentera själva domen mot mannen men säger att ambassadpersonal var på plats när straffet meddelades.
– Han har ju sagt att han ska överklaga domen, så vi kommer att fortsätta följa processen, säger Jörle till TT.
UD har fått kritik, bland annat av den svenske riksdagsledamoten Jens Holm (V) som vittnat till mannens försvar, för att inte ha engagerat sig tillräckligt i fallet. Bland annat fanns inte ambassadpersonal på plats när domen föll.
Den venezuelanske advokaten och författaren Luis Britto Garcia, medlem av Venezuelas nyetablerade Statsråd, har tidigare engagerat sig i fallet.
Trots att Statsrådet är rådgivande till president Hugo Chavez är Britto Garcia kritisk till Venezuelas roll.
– Jag anser att han utlämnades i strid med internationell och nationell rätt och han borde skickas hem till Sverige, säger Britto under ett besök i Stockholm.
Enligt Britto handlar fallet om relationerna mellan Venezuela och Colombia, där Farc länge varit en nagel i ögat.
– Enligt min mening handlade det ytterst om ett offer för freden med Colombia.
Att Venezuela inte bemött Sveriges klagomål på utlämningen tycker han inte är konstigt.
– Det finns inget svar att ge. Man kan inte överlämna en person för politiska brott.
56-åringen greps den 23 april i fjol på flygplatsen i Caracas efter ett telefonsamtal från den colombianske presidenten Juan Manuel Santos till kollegan Hugo Chavez i Venezuela, enligt colombianska El Tiempo.
Beslutet om att utlämna honom till Colombia några dagar senare mötte kritik även inom Chavez egna led, uppger EFE.
Botogotaregeringen hade sedan länge velat få tag på mannen, som anklagades för att vara rebellgruppen Farcs Europachef och finansiär. 56-åringen, som är svensk medborgare efter att ha beviljats politisk asyl, har i Stockholm drivit internetsajten Anncol. Han har genomgående förnekat att han arbetar för Farc, utan säger att han talat med gerillan i egenskap av journalist.
I förra veckan dömdes svensken för grov förberedelse till brott, men friades från anklagelser om terrorfinansiering.
Svenskens advokat Rodolfo Rios bekräftar att försvaret kommer att överklaga domen, något som kommer att ske inom de kommande fem dagarna. Rios ser goda chanser att få domen uppriven.
– Om högsta domstolen i Bogota utvärderar bevisen objektivt kommer de helt säkert att fria honom, säger Rios.
– Vi kommer att visa för högsta domstolen att domaren begick misstag när de bedömde bevismaterialet. Det var politiskt omöjligt för domaren att döma mannen för det skulle fått konsekvenser för honom själv.
Samtidigt kommer åklagarsidan, som vill se 56-åringen dömd även för terrorfinansiering, att förbereda sin överklagan. Sedan kommer det att ta ett par månader för domstolen att reda ut överklagan.
Rios tycker att de svenska myndigheterna har visat allt större intresse för fallet i takt med att rättegången utspelat sig, och säger att de ofta varit närvarande under förhandlingarna.
– Jag har sett en stor förändring från den svenska regeringen. Diplomatkåren har kunnat se att det handlar om en bristfällig process.