Samtliga 129 passagerare och åtta i besättningen evakuerades när planet landat på Takamatsu-flygplatsen. Problemet ska ha varit rök i cockpit orsakad av problem med ett batteri. Enligt polisen skadades ett antal av passagerarna lindrigt under evakueringen.
Transportdepartementet i Tokyo betraktar dagens nödlandning som en allvarlig händelse som kunde slutat i en olycka, enligt nyhetsbyrån Kyodo. Planet var på väg på väg från Ube i västra Japan till Tokyo.
Också ANA:s konkurrent Japan Airlines, JAL, låter sina sju plan stå kvar på marken tills man hunnit göra säkerhetskontroller av dem.
Indien ska också göra en säkerhetskontroll av Air Indias Dreamlinerplan, meddelar ledningen för civilflyget. Men det finns inga planer på att ställa in flygningar "just nu".
Air India har köpt 27 Dreamliners. Sex av dem har levererats och resten ska komma fram till 2016.
Den amerikanska flygmyndigheten FAA har redan en granskning igång av flygplansmodellen och kommer också att titta på onsdagens nödlandning. Bland annat vill FAA att monteringen av bränslesystemet på alla Boeings 787 Dreamlinerplan kontrolleras. Beslutet om den inspektionen togs sedan en helt ny 787 Dreamliner med 184 människor ombord i december tvingades vända och nödlanda i New Orleans efter att ett mekaniskt fel upptäckts. Planet var på väg från Houston till Newark.
Dreamlinerplanen har haft upprepade problem den senaste tiden, trots Boeings försäkran om att planen är säkra. I förra veckan brann ett batteri i ett av JAL:s plan som stod tomt i Boston, USA och ett annat av flygbolagets plan hade en bränsleläcka på samma flygplats.
Boeing 787, den nya Dreamlinern, är samma typ av flygplan som flygbolaget Norwegian ska använda i sin kommande satsning på billiga långdistansflygningar till Bangkok och New York.
Norwegians informationschef, Åsa Larsson, känner sig dock trygg med den utredning som Boeing gör och ser ingen fara i att lågprissatsningen hotas.
– Vi har beställt åtta flygplan av den här typen. Det första får vi i slutet av april och det andra kommer till sommaren. Vi välkomnar naturligtvis utredningen, men i dagsläget finns det inget som tyder på att den påverkar vår satsning. Vi har en tät dialog med Boeing och vi ser fram emot att få vårt första flygplan i april.
Enligt satsningen kommer priset för vissa längre flygningar att sjunka rejält. Det lägsta priset ligger runt 2 400 kronor för en resa till New York tur och retur.