Flera andra personer skadades. Besökarna var på väg ut ur moskén när bomben exploderade i Rokn Eddin i norra Damaskus.
Senare på fredagen orsakade en bilbomb skador nära en domstol i centrum, utan att kräva några dödsoffer.
Vittnen uppgav att stadsdelen Tadamun och det närliggande palestinska flyktinglägret Yarmuk utsattes för granatbeskjutning.