Aktivistnätverket Lokala samordningskommittéerna rapporterade att massakern ägde rum i al-Qubair och att 35 av offren var medlemmar av samma familj.
Syriska människorättsobservatoriet (SOHR) sade på torsdagsförmiddagen att antalet döda uppgår till minst 55.
– Det finns 49 bekräftade och identifierade offer i al-Qubair, de flesta av dem från släkten al-Yatim, sade SOHR-företrädaren Rami Abd al-Rahman, och tillade att ytterligare sex offer har hittats i närheten.
Siffrorna går dock isär. Enligt Mohammed Sermini, talesman för oppositionsgruppen Syriens nationella råd, hade "regimstyrkor dödat omkring 100 människor, bland dem 20 kvinnor och 20 barn".
Medan vittnen och oppositionen uppgav att regeringstrogen milis stod bakom massakern, anklagade regeringen "beväpnade grupper" för att han iscensatt blodbadet för att få till stånd en utländsk militär intervention.
Syriska människorättsobservatoriet (SOHR), med säte i London, sade att massakern utfördes av den regimtrogna shabiha-milisen efter det att reguljära styrkor bombat området.
Tillvägagångssättet påminner om det vid en massaker i al-Hula i grannprovinsen Homs för knappt två veckor sedan.
I en kommuniké som lästes upp i tv på torsdagen avvisar regimen nästan alla uppgifter om händelserna i al-Qubair.
"Det en del medier har rapporterat om vad som hänt i al-Qubair, nära Hama, är helt falskt", heter det. "En terroristgrupp begick ett fasansfullt brott i Hamaområdet, som krävde nio liv".
Oppositionens organisationer står fast vid sina uppgifter om cirka 100 döda i en massaker i byn.
I Istanbul beslutade ministrar och andra representanter för 15 länder, som samlats där för att diskutera Syrien, att kalla samman en "samordningsgrupp" för att organisera stödet till den syriska oppositionen.
Mötet diskuterade "ytterligare steg", däribland samordning av "en effektiv och trovärdig övergångsprocess" som ska leda till ett "Syrien efter Assad".
Mötet enades också om att sända en representant till den syriska oppositionens möte i Istanbul den 15–16 juni och att alla länder inom Syriens vänner ska mötas i Paris den 6 juli.
Syriens största oppositionsgrupp, Syriens nationella råd, manar till ökad väpnad kamp efter massakern i Hama.
Rådet har tidigare varit försiktigt med att direkt uppmana till militära aktioner mot regeringstrupperna, men säger nu att rebellrörelsen Syriska fria armén ska trappa upp "verksamheten på slagfältet".
Under natten till torsdagen utbröt häftiga strider i utkanterna av Damaskus och i huvudstadens förstäder, uppgav oppositionen.
Invånare i Damaskus centrum sade att de hörde kraftig eldgivning och aktivister i förstäderna talade om explosioner och eld från automatvapen. På flera platser sågs helikoptrar flyga lågt över bebyggelsen.